1993年，时年17岁的斯托贾科维奇取得希腊国籍（并保留了塞尔维亚国籍），同时从贝尔格莱德红星转投PAOK Thessaloniki俱乐部。正是在PAOK俱乐部效力的这段时间，他得到了“佩贾”的绰号。
斯托贾科维奇，其实并不叫佩贾，而是叫普雷德拉格-斯托贾科维奇(Predrag Stojakovic)。他出生于克罗地亚，父母是塞尔维亚国籍，南斯拉夫内战时他们一家人逃到了塞尔维亚首都贝尔格莱德。
虽然如今的佩贾已经定居美国，把工作重心全都放在了北美，但是在他家里贝尔格莱德红星是永远的主队。佩贾的父母至今仍然是这支球队的忠实球迷。1992-1994年，佩贾也曾效力于这支球队。
斯托贾科维奇曾在希腊陆军服役，在这个国家，参军是每个成年男子必须履行的义务。
在1998年的希腊篮球联赛的季后赛中，佩贾所在的PAOK对上了传统豪门帕纳辛纳科斯斯托贾科维奇，防守佩贾的是前湖人球员拜伦·斯科特。由于后者的严防死守，佩贾没能发挥出应有的实力，球队最终以2比3输掉了这个系列赛。
这还没完，1998年佩贾正式和国王签下合同登陆NBA斯托贾科维奇，而1998-99和1999-00赛季，拜伦·斯科特在国王队担任助理教练。斯科特在队期间，佩贾一直坐穿板凳，然而斯科特一离队，佩贾迅速变成首发并场均20+，在NBA的最快进步奖评选中名列第二（感谢斯科特）。
2001年的欧锦赛，佩贾代表南斯拉夫出战（2000年奥运会也是），并勇夺桂冠，加盟赛会最有价值球员。2002年，佩贾又随南斯拉夫征战世锦赛，一路击败美国队和阿根廷队夺得冠军。
佩贾是NBA第五位在三分大赛的两轮比赛中都拿到第一的球员，另外的四位是伯德、霍纳塞克、霍奇斯和马克·普莱斯。同时，佩贾也是NBA史上首位在全明星周末拿到奖项的欧洲球员。
2001年，佩贾被欧洲销量最大的体育类报刊《米兰体育报》评选为年度NBA最佳欧洲球员，这个奖含金量也是很高的斯托贾科维奇，过往获得者包括佩特洛维奇、库科奇和萨博尼斯。
2004-05赛季，国王处理掉了年迈的迪瓦茨，令佩贾十分失望。传言说，国王同时还想用佩贾换罗恩·阿泰斯特，不过由于奥本山宫事件未能成行。当然我们也都知道，2006年国王和步行者还是做成了这笔交易。
2006年11月14日，黄蜂对阵山猫队的比赛中，佩贾拿下了职业生涯最高的42分。特别值得一提的是，本场比赛他报班了球队开场的全部前20分，是NBA历史上首位做到这一点的球员。
